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Title: Modélisations des interactions dipeptidyl peptidase 4– inhibiteurs à l’aide de technique de docking moléculaire.
Authors: Fatima , KECHACHA , HABILA, BOUADJEL Hadil , Omaima
Keywords: Type 2 diabetes, dipeptidyl peptidase 4, molecular docking, Surflex-dock
Issue Date: Jun-2023
Publisher: university center of abdalhafid boussouf - MILA
Citation: Biochimie appliquée
Abstract: Type 2 diabetes is a chronic and painless disease. It is characterized by excessive high blood sugar levels. This accumulation of blood results from a disturbance in the absorption, use and storage of sugars provided by food. In our work, we focused on how to treat type 2 diabetes by inhibiting dipeptidyl peptidase 4 which is an enzyme used in decomposition of encritins, it strengthens the effect of glucose on insulin secretion and improves blood sugar control in diabetic patients.To carry out this work, we use the molecular modeling methods and more specifically the molecular docking approach by Surflex-dock software, it has been shown to be effective enough to reproduce the experimental test since 72.50% of RMSD values are less than 2Å. According to visual analysis, we were able to confirm the program's performance. This method was used to study the interaction mode of dipetidyl peptidase 4-inhibitor complexes and to detect in silico new and more effective inhibitors. In this study we highlighted the compounds CID 145676316 and CID 68023157 as new antidiabetic agents with more affinities compared to previously known agent. Finally, we predicted the physical, chemical and kinetic properties and also verified the toxicity of these new proposed compounds
Description: Le diabète de type 2 est une maladie chronique, silencieuse et indolore, qui se caractérise par un taux de sucre trop élevé dans le sang. Cette accumulation dans le sang est due à un trouble de l’assimilation, de l’utilisation et du stockage des sucres apportés par l’alimentation. Dans notre travail, nous avons focalisés sur le traitement du diabète de type 2 basé sur l’inhibition de la dipeptidyl peptidase 4. Ce dernier c’est une nzyme qui sert à la dégradation des incrétines ; ils potentialisent l’effet du glucose sur la sécrétion d’insuline et méliorent l'équilibre glycémique chez les patients diabétiques. Pour réaliser ce travail, en faisant appel aux méthodes de modélisation moléculaire plus particulièrement le docking par le programme Surflex-dock qu’il est avéré assez performant pour reproduire le test expérimental puisque 72,50% des valeurs de RMSD sont inférieures à 2Å et d’après l’analyse visuelle des ligands nous avons pu confirmer la performance de ce programme. Cette méthode a été utilisée pour étudier le mode d’interaction des complexes dipeptidyl peptidase 4-inhibiteurs et de découvrir in silico de nouveaux inhibiteurs plus puissants. Cette étude a fait essortir les composés CID 145676316 et CID 68023157 comme des nouveaux agents antidiabétiques avec plus d'affinités par rapport aux agents précédemment connus. Enfin, Nous avons prédit les propriétés hysicochimiques, pharmacocinétiques et vérifie aussi la toxicité de ces nouvelles molécules proposées.
URI: http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/2660
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