Please use this identifier to cite or link to this item:
http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/244| Title: | In silico characterization of Zika virus envelope protein structure (2019) |
| Authors: | BOULDJEDJE, Sofia AMOURA, AMOURA Hamida |
| Keywords: | Key words: Zika virus, envelope protein, phylogenetic analysis, 3D protein structure prediction |
| Issue Date: | Nov-2020 |
| Publisher: | Centre Universitaire Abdelhafid BOUSSOUF de Mila |
| Abstract: | Abstract Zika virus (ZIKV) is a positive single-stranded RNA virus that is transmitted by mosquito bites. ZIKV envelope protein is antigenic and is involved in fusion and entry of viral particles into the cell. In this study, we have conducted a multiple sequence alignment of envelope protein structures collected from UniProt, using Clustal Omega tool on UniProt. Also, a phylogenetic analysis of Zika strains, isolated from several regions of Africa, Asia, America and Oceania was performed by MEGA 6.0 software. In addition, the three-dimensional structure of ZIKV envelope protein was predicted using SWISS-MODEL. |
| Description: | Le virus Zika (ZIKV) est un virus à ARN positif simple brin transmis par les piqûres de moustiques. La protéine d'enveloppe ZIKV est un antigène et est impliquée dans la fusion et l'entrée de particules virales dans la cellule. Dans cette étude, nous avons effectué plusieurs alignements de séquences de structures de protéines d'enveloppes collectées à partir d'UniProt, à l'aide de l'outil Clustal Omega sur UniProt. De plus, l'analyse phylogénétique des souches de Zika, isolées dans plusieurs régions d'Afrique, d'Asie, d'Amérique et d'Océanie, a été réalisée par le logiciel MEGA 6.0. De plus, la structure 3D de la protéine d'enveloppe ZIKV a été prédite en utilisant SWISS-MODEL. |
| URI: | http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/244 |
| Appears in Collections: | Natural and life sciences |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.