Prédiction in silico de nouveaux inhibiteurs de l’alpha-glucosidase

Abstract

Le diabète est une maladie chronique caractérisée par une hyperglycémie qui survient lorsque le pancréas ne produit pas assez d’insuline ou lorsque l’organisme n’est pas capable d’utiliser efficacement l’insuline qu’il produit . Le diabète de type 2 constitue aujourd’hui un problème majeur de santé publique à l’échelle mondiale. Dans notre travail, nous sommes focalisés sur le traitement de ce type de diabète par l’inhibition de l’alpha-glucosidase humain, une enzyme qui hydrolyse les liaisons α-1→4 des polysaccharides. Le programme de docking moléculaire Surflex-dock a été développé pour aider à la mise au point des molécules à activité thérapeutique. Avec un taux de valeurs de RMSD inférieures ou égales à 2 Å de 76 %, les performances du programme Surflex sont avérées. Ce test a été suivi d’une analyse visuelle de la superposition des ligands de référence et ceux obtenus par docking moléculaire. Dans cette étude , ce programme a été utilisé pour étudier l’inhibition de l’alphaglucosidase humaine par diverses composés afin d’identifier les meilleurs, qui sont les W9G et VND. Le criblage virtuel d’une collection de 77 composés issus de la banque de données PubChem, similaires de l’inhibiteur W9G a fait ressortir les composés CID44343625, CID101342889 comme de nouveaux inhibiteurs potentiels de l’alpha-glucosidase avec plus d’affinité par rapport à l’inhibiteur de référence . Enfin, l'application de la règle de 5 de Lipinski nous informe de manière positive sur les propriétés physicochimiques de ces nouvelles molécules proposées .