Please use this identifier to cite or link to this item: http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/1962
Title: Détermination de mode de liaison de la thymoquinone et ses dérivées contre la xanthine oxydoréductase avec la simulation informatique
Authors: Manal, ABD ELALI
Keywords: Xanthine oxydoréductase, la goutte, docking moléculaire, Surflex-dock, RMSD, règle de Lipinski.
Xanthine oxidoreductase, gout, molecular docking, Surflex-dock, RMSD, Lipinski rule.
Issue Date: Jun-2022
Publisher: university center of abdalhafid boussouf - MILA
Abstract: Notre travail, entre dans le cadre de la réalisation du mémoire de master, s’inscrit dans le courant de la recherche in silico des nouveaux inhibiteurs potentiels de la xanthine oxydoréductase (XOR) ; cible thérapeutique validée pour le traitement de la maladie de la goutte. Le logiciel de docking moléculaire Surflex-dock permet de simuler les interactions entre une cible enzymatique et différents ligands. Avec un pourcentage de 85% des valeurs de RMSD inférieures ou égales à 2 Å, on peut dire que Surflex-dock est assez performant et on peut l’utiliser en toute confiance pour étudier profondément le mécanisme d’inhibition de la XOR. Dans cette étude, nous avons réalisé un docking basé sur la structure de la cible enzymatique avec le programme Surflex-dock d’une collection de 193 similaires de la thymoquinone issus de la PubChem ; afin de découvrir de nouveaux inhibiteurs potentiels de l’enzyme XOR plus affins et plus sélectifs que la TEI et la thymoquinone, inhibiteurs précédemment connu. Deux similaires : CID_129829816 et CID_132131050 avec des affinités égales à 6.96 et 6.82 M-1 respectivement, sont considérés comme les meilleurs inhibiteurs potentiels de la XOR. Enfin, l’application de la règle de Lipinski nous informe de manière positive sur les propriétés physicochimiques de ces deux inhibiteurs.
Description: Our work is part of the master's thesis, is part of the current in silico search for new potential xanthine oxidoreductase inhibitors (XOR); therapeutic target validated for the treatment of gout disease. The software of molecular docking Surflex-dock makes it possible to simulate the interactions between enzymatic target and different ligands. With a percentage of 85% of RMSD values less than or equal to 2 Å, we can say that Surflex-dock is quite efficient and we can use it with confidence to study deeply the mechanism of XOR inhibition. In this study, we performed a docking based on the structure of the enzymatic target with the Surflex-dock program from a collection of 193 thymoquinone similars from PubChem; to discover new potential inhibitors of the XOR enzyme more affine and more selective than TEI and thymoquinone, inhibitors previously known. Two similars: CID_129829816 and CID_132131050 with affinities equal to 6.96 and 6.82 M-1 respectively, are considered the best potential XOR inhibitors. Finally, the application of Lipinski's rule informs us positively about the physicochemical properties of these two inhibitors.
URI: http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/1962
Appears in Collections:Natural and life sciences

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Détermination de mode de liaison de la thymoquinone.pdf3,78 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.