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http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/3857Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | Insaf, Bayou,Kourteli Besma | - |
| dc.date.accessioned | 2024-10-06T10:36:42Z | - |
| dc.date.available | 2024-10-06T10:36:42Z | - |
| dc.date.issued | 2024-06 | - |
| dc.identifier.citation | Spécialité : Biochimie Appliquée | en_US |
| dc.identifier.uri | http://dspace.centre-univ-mila.dz/jspui/handle/123456789/3857 | - |
| dc.description | The discovery of antibiotics gave rise to hope that it would one day be possible to control all infectious diseases. However, the excessive use of antibiotics leading to the increase in the number of multi-drug resistant bacteria has become a key health threat globally. This makes it necessary to develop new therapeutic strategies, based in particular on the search for new molecules capable of acting as new antibacterial agents. During this work, we relied on the treatment of bacterial infections based on the inhibition of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reducto-isomerase (DXR), an essential enzyme of the non-mevalonic pathway of synthesis of isoprenoids, in most pathogenic microorganisms. The main objective of this research is to acquire skills in molecular modeling, the most important of which is virtual screening which is based on molecular docking by Surflex-dock in order to contribute to the in silico development of new, more powerful and more selective inhibitors of DXR of Mycobacterium tuberculosis. Our results show that the Surflex-dock program is efficient enough to contribute to the development of new molecules with therapeutic activity with 94.05% of the calculated RMSD values being less than or equal to 2Å. This test was followed by a visual analysis of the superposition of Co-crystallized ligands. These tests allow us to consider Surflex-dock as a high-performance docking program. Molecular docking of a collection of 236 similar 6JB inhibitors from the PubChem chemical library highlights the compounds CID14555675, CID49801563, CID113304440 and CID60701454 as the best DXR inhibitors with affinities equal to 8.73 M-1, 8 .99 M-1, 8.20 M-1 and 8.64 M-1 respectively. Finally, the ADME-Tox filtering application provides us with positive information on the physicochemical, pharmacokinetic and toxicological properties of the proposed inhibitors. | en_US |
| dc.description.sponsorship | La découverte des antibiotiques a fait naître l'espoir qu'il serait un jour possible de juguler l'ensemble des maladies infectieuses. Cependant, l’utilisation excessive des antibiotiques conduit à l’augmentation du nombre de bactéries multirésistantes est devenue une menace sanitaire essentielle au niveau mondial. Ceci rend nécessaire le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques, basées notamment sur la recherche de nouvelles molécules capables d'agir comme nouveaux agents antibactériens. Au cours de ce travail, nous nous sommes appuyés sur le traitement des infections bactériennes basé sur l’inhibition de la 1-désoxy-D-xylulose 5-phosphate réducto-isomérase (DXR), une enzyme essentielle de la voie non-mévalonique de synthèse des isoprénoides, chez la plupart des microorganismes pathogènes. L’objectif principal de cette recherche est d’acquérir des compétences en modélisation moléculaire, dont la plus importante est le criblage virtuel qui est basé sur le docking moléculaire par Surflex-dock afin de contribuer au développement in silico de nouveaux inhibiteurs plus puissants et plus sélectifs de la DXR de Mycobacterium tuberculosis. Nos résultats montrent que le programme Surflex-dock est assez performant pour contribué à la mise au point des nouvelles molécules à activité thérapeutique avec 94,05 % des valeurs de RMSD calculées sont inférieures ou égale à 2 Å. Ce test a été suivi d'une analyse visuelle de la superposition des ligands Co-cristallisés. Ces tests nous permettent de considérer Surflex-dock comme un programme de docking hautement performant. Le docking moléculaire d’une collection de 236 similaires de l’inhibiteur 6JB issus de la chimiothèque PubChem, fait ressortir les composés CID14555675, CID49801563, CID113304440 et CID60701454 comme meilleurs inhibiteurs de la DXR avec des affinités égale à 8,73 M-1, 8,99 M-1, 8,20 M-1 et 8.64 M-1 respectivement. Enfin, l’application de filtrage ADME-Tox nous renseigne de façon positive sur les propriétés physicochimiques, pharmacocinétiques et toxicologiques des inhibiteurs proposés. | en_US |
| dc.language.iso | fr | en_US |
| dc.publisher | university centre of abdelhafid boussouf -mila- | en_US |
| dc.subject | Agents antibactériens, Docking moléculaire, Surflex-dock, DXR, RMSD, Filtrage ADME-Tox | en_US |
| dc.subject | Antibacterial agents, Molecular docking, Surflex-dock, DXR, RMSD, ADME-Tox filtration | en_US |
| dc.title | Application d'une approche de criblage virtuel pour la découverte de nouveaux agents antibactériens | en_US |
| dc.type | Thesis | en_US |
| Appears in Collections: | Natural and life sciences | |
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| File | Description | Size | Format | |
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| Application d_une approche de criblage virtuel pour la découverte de nouveaux agents antibactériens.pdf | 5,66 MB | Adobe PDF | View/Open |
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