Approche pour la conception de médicaments assistée par ordinateur

Abstract

Le processus de découvert de médicament traditionnelle connue comme le nom de Drug design rationnelle est un processus très Long et couteux, il prend de 12 a 15 ans. La conception de médicament assisté par ordinateur (computer aided drug design CADD) est une nouvelle technique qui apparait ces dernieres années, cette technique permet de développer des nouveaux médicaments en utilisant l’ordinateur, l’utilisation de l’ordinateur dans ce domaine permet de produire des médicaments efficaces en réduisant le temps et le cout de développement. Il existe plusieurs approches dans cette technique, parmi ces approches nous avons l’approche de novo drug design. C’est une approche très puissante qui permet de générer des médicaments qui satisfirent certaines propriétés comme la propriété favorable ADME/TOX. A cause de développement continue dans le domaine de pharmacie, et de la nouveauté de la conception de médicament assisté par ordinateur, nous proposons de réaliser un outil qui permet de générer des nouveaux molécules (médicaments) qui satisfaire certains propriétés, ici nous choisissons de satisfaire deux propriétés : la bio disponibilité orale OBA et la propriété de similarité a un médicament connu en utilisant le coefficient de animoto. Notre objectif ce n’est pas seulement de satisfaire ces deux propriétés mais aussi de définir ce nouveau domaine, de donner une base de recherche et de développement, et d’aider les pharmacies en Algérie de développer des médicaments de qualité en réduisant le temps le cout et les efforts. Le problème DND est un problème NP_complét pour cela dans notre outil MOGA_DND nous essayons d’appliquer les algorithmes génétique multi objectifs, en utilisant l’approche d’optimisation de somme pondéré par agrégation des deux objectifs (OBA et le coefficient de Tanimoto). Une étude expérimentale en utilisant un ensemble de Library de fragment construire a partir d’une base de donné de la chemoinformatique , et la Library open source java CDK (Chimistry Developement Kit) est réalisé. Cette étude donne des résultats prometteurs.